目前和记黄埔医药开发的药物主要在癌症和自身免疫性疾病治疗领域，公司现有两个创新药物在美国进行临床实验，同时公司还有多个项目正在中国处于临床前及临床申报阶段。在研产品包括合成小分子化合物、半合成天然产物以及植物药的创新药物。
HMPL-004
治疗炎症性肠病
HMPL-004公司开发的拥有自主知识产权的新药。和黄医药采用了先进的药物筛选技术、现代药物开发工艺，从一种传统中药中精制出具有免疫抑制、消炎镇痛作用的有效部位，通过系统的药理药学研究对其机理进行科学的证明和阐述，HMPL-004具有特殊的多靶点作用机理。2005年8月，HMPL-004获美国FDA批准进行治疗炎症性肠病(IBD)的II期临床研究。该项研究是一项多中心、随机、双盲、安慰剂对照II期临床试验。初步临床研究显示HMPL-004治疗溃疡性结肠炎，与一线治疗药美莎拉秦比较，更低剂量的HMPL-004与其疗效相同。HMPL-004安全性优于对照药。
HMPL-002
治疗肿瘤
HMPL-002是一种单一植物来源的放化疗增敏剂，用于治疗头颈癌、肺癌、或食道癌，目前与放化疗结合。HMPL-002通过改变氧的动态平衡，抑制肿瘤细胞的多条代谢途径，发挥放化疗增敏作用。2005年2月美国 FDA在检阅过和黄医药对新药HMPL-002的药品临床研究申请后，批准了其在美国进行I / II期人体临床试验。和黄医药已在美国和中国就HMPL-002新的适应症、新的制剂及新的用途申请了七项专利。
同时公司还有多个项目处于临床前研究阶段，这些项目包括化学合成的和天然来源改造的新分子实体化合物。